蛋白质磷酸化修饰是指在磷酸化激酶的作用下将ATP的磷酸基转移到蛋白质特定氨基酸上的过程，是生物体内常见且重要的翻译后修饰之一。生物体内蛋白质的磷酸化修饰是一个瞬时且可逆的过程，通过磷酸化修饰可以改变蛋白质空间构象，从而影响蛋白质的定位、活性及其与其他蛋白的相互作用。
上期小鹿盘点了14篇磷酸化修饰蛋白组学研究在医学研究中的应用
CNS大盘点—蛋白组学+磷酸化组学双重思路升级，新一代4D蛋白组学的高阶应用~
CNS新思路—蛋白组+磷酸化修饰组：挖掘生物调控研究新视角大盘点！
本期小鹿继上期在植物研究及动物研究盘点磷酸化修饰蛋白组学相关文章。给各位老师研究提供强有力参考~
植物方向
1.钙渗透通道OSCA1.3调节植物气孔免疫
Thecalcium-permeablechannelOSCA1.3regulatesplantstomatalimmunity
发表期刊：Nature
年份：年
物种：拟南芥
组学技术：蛋白质组、磷酸化蛋白质组、基因组
研究内容：
对生物和非生物胁迫的感知通常导致植物气孔关闭。钙离子(Ca)穿过质膜的快速流入在这种反应中起着重要作用，但是所涉及的Ca通道的身份仍然难以确定。
在这里，作者报道了拟南芥Ca渗透通道OSCA1.3在免疫信号传递过程中控制气孔关闭。OSCA1.3在感知病原体相关分子模式(PAMPs)后迅速磷酸化。生化和定量磷酸化蛋白质组学分析显示，免疫受体相关的胞质激酶BIK1在用源自细菌鞭毛蛋白的肽PAMPflg22处理后几分钟内与OSCA1.3的N端胞质环相互作用并磷酸化。遗传和电生理数据显示，OSCA1.3对Ca具有渗透性，并且其N端BIK1介导的磷酸化增加了这种通道活性。值得注意的是，OSCA1.3及其被BIK1磷酸化对于免疫信号传导期间的气孔关闭至关重要，并且OSCA1.3在感知脱落酸(一种与非生物胁迫相关的植物激素)时不调节气孔关闭。
因此，这项研究确定了植物Ca通道及其在免疫信号传递过程中气孔关闭的激活机制，并提出了Ca2+流入机制对不同胁迫反应的特异性。
2.基于质谱的拟南芥蛋白质组草图
Mass-spectrometry-baseddraftoftheArabidopsisproteome
发表期刊：Nature
年份：年
物种：拟南芥
样本：花絮、种子、叶、根、愈伤组织等
组学技术：转录组、Labelfree蛋白质组、Labelfree磷酸化蛋白质组
研究内容：
植物是生命所必需的，是极其多样化的有机体，具有独特的分子能力。本文作者报道了拟南芥30个组织的转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组的定量图谱。研究者的分析为有多少基因以蛋白质的形式存在（超过个）、它们在哪里表达、数量（超过六个数量级的动态范围）以及它们被磷酸化的程度（超过个位点）提供了初步答案。研究者举例说明如何使用这些数据，例如发现从短的开放阅读框翻译的蛋白质，揭示与蛋白质调控有关的序列，以及识别组织特异性蛋白质复合物或磷酸化介导的信号事件。ProteomicsDB和ATHENA数据库为植物群落提供了对这一资源的交互式访问，其中包括强大的生物信息学工具，用于探索和表征拟南芥蛋白质、修饰和相互作用。
3.一种传感器激酶控制稻瘟病真菌对膨胀驱动的植物感染
Asensorkinasecontrolsturgor-drivenplantinfectionbythericeblastfungus
期刊：Nature
年份：年
物种：水稻
疾病：稻瘟病
样本：组织、细胞
组学技术：磷酸化蛋白质组学、转录组、基因组
研究内容：
稻瘟病对全球的粮食安全是一个巨大的威胁，尽管目前对稻瘟病菌的入侵方式已基本明确，但是在附着胞介导的侵染宿主的过程中，附着胞内部膨压调节的分子机制仍不清楚。在本次研究中，鉴定到稻瘟病菌侵染过程中位于附着胞的一个膨压感受器——组氨酸-天冬氨酸激酶（Sln1）。当感知到阈值范围内的膨压后，Sln1调控黑色素的生物合成和甘油的生成，之后Sln1通过Pkc1依赖性的细胞完整性途径发挥作用，激活Nox2-NoxRNADPH氧化酶或调控PKA途径，从而共同调节附着胞膨压和入侵栓形成来完成侵染过程。本研究为稻瘟病防治提供新的参考。
动物方向
4.SARSCoV-2感染的全局磷酸化图谱
TheGlobalPhosphorylationLandscapeofSARS-CoV-2Infection
期刊：Cell
年份：年
物种：猴
疾病：新型冠状病*
组学技术：蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学
研究内容：
新冠肺炎在全国流行，对SARSCoV-2感染的VeroE6细胞进行的磷酸化蛋白质组学分析揭示了被病*感染劫持的宿主细胞途径，从而确定了靶向失调途径并引发有效抗病*功效的小分子。通过分析宿主和病*蛋白上磷酸化的变化，量化SARS-CoV-2感染后VeroE6细胞的生命活动进程，从而揭示了COVID-19的发病机制，并确定了具有SARS-CoV-2治疗潜力的药物。磷酸化蛋白质组学用于SARS-CoV-2感染机制研究，有利于开发有效的治疗剂。
5.没有时钟基因Bmal1的昼夜节律
CircadianrhythmsintheabsenceoftheclockgeneBmal1
期刊：Science
年份：年
物种：小鼠
样本：皮肤成纤维组织、肝组织
组学技术：转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组
研究内容：
昼夜节律（~24小时）时钟在调节日常生理方面起着基本作用。转录因子Bmal1是哺乳动物分子钟的主要驱动因子。Bmal1缺失消除了24小时活动模式，这是时钟输出的一种度量。作者确定了Bmal1功能是否对皮肤成纤维细胞和肝切片的日常分子振荡是必要的。出乎意料的是，在Bmal1基因敲除小鼠中，在没有任何外源性驱动因素（如每日光照或温度周期）的情况下，两种组织的转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组在2到3天内出现振荡。
6.睡眠-觉醒周期驱动突触磷酸化的日常动态
Sleep-wakecyclesdrivedailydynamicsofsynapticphosphorylation
期刊：Science
年份：年
物种：小鼠
样本：前脑匀浆
组学技术：磷酸化蛋白质组学
研究内容：
昼夜节律相关磷酸化能控制外周器官的细胞过程，但在脑功能与突出活动过程中的作用研究较少。本实验将小鼠置于12h:12h（光暗）周期中，设置6个时间点，每隔4小时安乐死4只小鼠，收集小鼠前脑组织分离出突触小体，应用磷酸化蛋白质组学进行分析。结果表明响应睡眠与觉醒激酶的磷酸激活是突触磷酸化动力学的核心驱动力，突触增强与觉醒和睡眠相关，通过睡眠剥夺诱发的高睡眠压力几乎完全消除了突触每日磷酸化周期的两个峰值。本实验推测磷酸化介导的突触信号调节可能是调节突触稳态和功能的睡眠-觉醒依赖机制的关键驱动力。
文末看点
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